随着各地经济项目日益增多，尤其是城镇化建设、招商引资等对土地的需求也越来越大。土地作为不可再生资源，也在逐渐减少，面对如此珍贵的土地，有些地方政府不惜违反国家法律政策，违法占地行为屡禁不止。

某村村民李某联合村干部未经批准于2000年非法占用本村集体耕地办厂。2017企业三次转手，现在经营管理该企业已不是本村村民，村干部也已换届。村民有意集体起诉要就收回该集体耕地。

在维权过程中，形成了两种意见：

一种意见认为，违法占地行为人已经不经营，怕不能再追究，案件很难胜诉；

另一种意见认为，违法占地的企业仍在正常经营，应追究违法占地行为法律责任。请问应如何处理该案？

行政处罚法》第二十九条规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。法律另有规定的除外。前款规定的期限，从违法行为发生之日起计算；违法行为有连续或者继续状态的，从行为终了之日起计算。

本案中，李某于2000年未经批准非法占用本村集体耕地建厂，存在非法占地行为和破坏耕地行为，按照上述处罚时效的规定，在李某实施违法行为二年内未被发现的，不再给予行政处罚。因于2017年转手，则不应对其进行行政处罚。

1997年，最高人民法院行政审判庭作出《关于如何计算土地违法行为追诉时效的答复》（（1997）法行字第26号，以下简称《答复》）。

该《答复》规定，对非法占用土地的违法行为，在未恢复原状之前，应视为具有继续状态，其行政处罚的追诉时效，应根据行政处罚法第二十九条第二款的规定，从违法行为终了之日起计算；破坏耕地的违法行为是否具有连续或继续状态，应根据案件的具体情况区别对待。

对经营企业的行为，因企业未办理相应的用地审批手续，经营人行为属于非法占地行为。依据《答复》，从经营管理的企业至国土资源部门发现违法行为进行立案调查，其违法行为处于继续状态，未超过行政处罚时效，可以进行立案调查并处罚。